北京时间8月28日晚19点整，2009/2010欧联杯小组抽签仪式正式举行，48支晋级球队被分为了12个小组，以下为具体抽签结果：
A组：阿贾克斯，安德莱赫特，萨格勒布迪纳莫，蒂米索拉
B组：瓦伦西亚，里尔，布拉格斯拉维亚，热那亚
C组：汉堡，凯尔特人，特拉维夫夏普尔，维也纳快速
D组：里斯本竞技，海伦芬，柏林赫塔，文茨皮尔斯
E组：罗马，巴塞尔，富勒姆，索菲亚中央陆军
F组：帕纳辛纳科斯，加拉塔萨雷，布加勒斯特迪纳莫，格拉兹
G组：比利亚雷亚尔，拉齐奥，索菲亚列夫斯基，萨尔茨堡
H组：布加勒斯特星，费内巴切，特温特，谢里夫
I组：本菲卡，埃弗顿，雅典AEK，博里索夫
J组：顿涅茨克矿工，布鲁日，贝尔格莱德游击，图卢兹
K组：埃因霍温，哥本哈根，布拉格斯巴达，克鲁日
L组：不来梅，奥地利维也纳，毕尔巴鄂竞技，葡萄牙国民
双循环，小组前两名出线，共24支球队。然后加上欧冠小组第三名的8支球队再抽签进行淘汰赛。
