作为东道主，葡萄牙自动成为A组种子，其他15支球队按照积分划分为4档，计算积分的方法为各队参加2002年世界杯预选赛和2004年欧洲杯预选赛(均不包括附加赛)的总积分除以总场次，按照这种方法，卫冕冠军法国与瑞典、捷克被划分到第一档。意大利、西班牙、英格兰、德国4支传统强队均分到第二档，其他8支球队也按照积分划分到最后2档，最引人注目的是第三档的荷兰。
大西洋展览馆是里斯本为1998年世博会兴建的。共有2千多名嘉宾出席抽签仪式，其中包括16支参赛队足协、欧足联、2004年欧洲杯组委会、葡萄牙政府的代表，还有来自全世界的大约700名记者。由于73岁的欧足联主席约翰松身体欠佳，抽签仪式由欧足联首席执行官艾格纳及其继任者、瑞典人奥尔松主持，但约翰松仍会出席下周在法兰克福举行的2006年世界杯抽签。
葡萄牙著名女歌手彭特丝的歌声揭开了抽签的序幕，葡萄牙副总理阿尔瑙特首先致辞，在短暂回顾了以往各届欧洲杯之后，葡萄牙足协主席马代尔讲话，然后会场播放视频，介绍了明年欧洲杯的举办城市与球场。2000年欧洲杯冠军法国队队长布兰克高举德劳内杯出场，将银杯交给了马代尔。
即将卸任的艾格纳宣读了分档与抽签规则，他把葡萄牙足球名宿尤西比奥、纽卡斯尔中场维也纳、布兰克、奥尔松请上主席台。尤西比奥首先抽出第1支第四档球队，位置是A2，接着各支球队各归其位。抽签在托卡-鲁法尔校园儿童乐团大约250面鼓的齐奏中结束。
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A组
葡萄牙 希腊
西班牙 俄罗斯
B组
法国 英格兰
瑞士 克罗地亚
C组
瑞典 保加利亚
丹麦 意大利
D组
捷克 拉脱维亚
德国 荷兰
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